दो भाई एडवर्ड और अल्फोंस एल्रिक, अपनी मृत मां को फ़िर से जीवित करने की कोशिश में, अपने शरीर के अंगो को खो देते हैं. अपने शरीर को ठीक करने के लिए वो दोनों साथ मिलकर फ़िलोसफ़र स्टोन को ढूंढने की कोशिश करते हैं.